Episode 2「紅色彗星」
在各方謀求「盒子」所在之處的宇宙，
巴納吉與"夏亞再世"遭遇了。
在畢斯特財團領導者卡帝亞斯臨終時受託，接下「拉普拉斯之盒」之「鑰」─MS『獨角獸』的少年巴納吉‧林克斯，在與「帶袖的」一方的瑪莉妲中尉所駕駛的 『剎帝利』交戰後，遭到隆德‧貝爾的突擊登陸艦『擬‧阿卡馬』捕獲。那艘艦艇上，收容了巴納吉的朋友拓也與米寇特，還有與卡帝亞斯接觸、要阻止他讓出 「盒」的少女奧黛莉‧伯恩。
面對這艘『擬‧阿卡馬』，一台以單機進行挑戰的MS出現了。駕駛名為「新安州」的紅色機體的人物，正是被稱為「夏亞再世」的「帶袖的」首腦──弗爾‧伏朗托。